生物反馈疗法对多种与社会心理应激有关的身心疾病都有较好的疗效，广泛地应用于治疗各科心身疾病、神经症和某些精神病。心身疾病如糖尿病、偏头痛、原发性高血压、心律不齐、支气管哮喘、消化性溃疡等。心理障碍如性功能障碍、早泄、儿童抽动障碍、注意力缺陷、多动症、失眠症、慢性精神分裂症和伴紧张、焦虑、恐惧的神经症等。生物反馈疗法还可应用于康复治疗、医疗保健中，如用来治疗大便失禁、瘫痪等。

生物反馈对于治疗一些特定的疾病具有很大的潜力，如通过血压的反馈来治疗高血压，通过肌电图的反馈来进行肌肉放松以抑制焦虑，通过脑电图的反馈来治疗癫痫等。到目前为止，生物反馈被广泛应用于治疗肌肉紧张。根据Jacobson、Shultz、Luthe、Whatmore和Kohi等人的研究，使用生物反馈技术可以更好地进行深度肌肉放松，改变同α波相结合的意识状态。①另一方面，生物反馈技术也可以同其他心理疗法相结合，例如同系统脱敏的结合，能够使患者更好地意识到自身躯体内部的情况。