西方医学、生理学为什么会停滞不前？究其源头，还得归咎到哲学、宗教身上。这里得先介绍一下名医盖伦生活的罗马帝国的情况。罗马帝国对文化、宗教相当宽容，许多宗教都和平共处，其中就包括了犹太教和基督教。犹太教与基督教关系有点复杂，简而言之，犹太教是犹太人创造的，基督教在犹太教的基础上发展而来，二者有共同点（都信上帝），也有不少矛盾之处。一开始，基督教处于弱势中的弱势，经常不被人理解，遭到打压。为了传教、辩论，一部分基督教徒学习了古希腊哲学，将哲学思想运用在传教上，为基督教制定了一整套教义体系，形成了所谓的教父哲学（Patristic Philosophy)o有了教父哲学之后，基督教如虎添翼，一举占据了主流地位，成了罗马的国教。

虽然冠以哲学的名头，但教父哲学其实是一种神学、一种宗教。哲学只是宗教用以包装自己的一个幌子。它逐渐用神学取代人学用宗教观取代科学观，哲学这个工具就被迅速抛诸脑后，真正的哲学家热衷于在辩论中得出真理，而神则不欢迎质疑，更不需要辩论。基督教认为灵魂和身体是独立的个体，共同之处在于他们都是上帝创造的。既然都是上帝创造的，那还有什么好研究的呢？他们强烈地反对人体解剖，将盖伦捧上神坛，杜绝了后来人纠正他一些错误的可能。为什么盖伦会被基督教捧上神坛？因为他从解剖的角度证明了上帝是多么的万能，这非常符合教徒的信仰。盖伦认为左心壁比右心壁厚，是为了保持心脏的垂直位置；动脉壁是致密的，是为了使动脉内的微小气体不能逸出…人体构造是如此精密而完美，除了万能的上帝，还有谁能做到？这种观点深受基督教的推崇，并将其奉为金科玉律。从此，盖伦成了医学教皇，所有观点都不容修改。谁指出盖伦的错误，谁就是对上帝的不敬，就是在挑战教廷的权威，后果很严重！

公元476年，西罗马帝国灭亡，欧洲进入封建社会，直到一千多年后的文艺复兴和大航海时代止，这段历史通常被人们称为“中世纪”，也就是中古时代的意思。在这段漫长的时间里，基督教神学一统天下、不容置疑，一举镇压了哲学、科学、医学等各种学科的发展，古希腊时期那样各种学派百花齐放的景象一去不返。漫长的一千多年里，人们匍匐在上帝脚下，不敢思考也不能思考，信仰如同一道无形的铁幕，牢牢挡住了自由意志与理性思考。