超个人心理治疗在西方国家已经得到广泛应用，尽管其理论有很多主观猜测，但在实际运用中它含有很多科学的成分。从它产生之日起，就在一些特殊领域得到有效应用。研究发现，超个人心理治疗在心理疾病治疗、生理功能改善、智力发展、道德水平提升、自我意识发展以及自我实现等方面都有积极的作用。通过超个人意识训练，还可以控制自主神经系统和躯体过程，起到改善心率、降低血压等作用。超个人心理治疗还可以应用到教育实践，比如将体验练习技术用到课堂教学，它对学生的学习和生活具有很大帮助。还有人将超个人心理治疗用于治疗酒精滥用患者和吸毒人员，实践证明，超个人心理治疗在这些领域也有较好的疗效。